Le sue origini sono antichissime: eretta nel 536 da un generale dell’imperatore Giustiniano. La chiesa di San Nicola, ricostruita e restaurata più volte, nel XIV secolo fu dedicata a San Nicola di Bari, probabilmente dalla potente famiglia Chiaramonte che vi fece realizzare la cappella del santo. L’aspetto attuale di questa proto-basilica risale al 1749, quando l’architetto Giovanni Biagio Amico fu incaricato dell’ampliamento della pianta a croce latina. Nel 1884 la chiesa fu in corsa, con San Pietro e San Lorenzo, per il rango di cattedrale che però non ottenne. Da dicembre 2025, con una meravigliosa apertura, è diventata sede del Museo diocesano di Trapani. La professoressa Lina Novara, direttrice del museo, vi guiderà tra le opere permanenti e le mostre temporanee, svelandone i tesori nascosti. Tra questi, un sarcofago marmoreo di epoca imperiale del III secolo e un trittico marmoreo, una splendida cona in bassorilievo che raffigura Gesù Cristo risuscitato ritratto tra san Pietro Apostolo e san Nicola di Bari, attribuito a Giacomo Gagini e datato 1560. Ma la visita riserva un’ulteriore sorpresa: la cripta sotto l’altare maggiore, perfettamente conservata, che mostra l’antico metodo di inumazione dei religiosi con i gocciolatoi per l’essiccazione dei cadaveri.